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为了研究番茄和马铃薯CIPK3基因的功能，利用生物学信息学的方法从番茄和马铃薯的基因组中分别鉴定出2个与拟南芥CIPK3同源的基因，并对这些基因的结构特征、系统进化和顺式元件进行了系统分析。结果表明，番茄和马铃薯的2个CIPK3基因均与拟南芥的CIPK3直系同源，且都含有14个外显子，编码区大小相似，编码蛋白预测都位于细胞膜上且含有的基序类型相同；在它们的编码区上游序列中均存在多个激素和逆境应答元件，暗示它们在激素和逆境应答中具有一定功能。