【摘 要】
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为了构建羊口疮病毒(Orf virus, OrfV)B2L-F1L截短融合基因,并对该基因序列进行生物信息学分析,试验采用DNAStar生物信息学软件分别对B2L、F1L基因序列进行分析,截取B2L、F1L基因序列的主要抗原区域,分别设计引物,利用重叠延伸PCR(SOE-PCR)技术对截取的B2L、F1L基因主要抗原区域进行融合,并与pMD-18T载体连接,构建重组质粒pMD18-T-B2L-F1
【基金项目】
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贵州省科技支撑计划项目(黔科合支撑[2018]2264); 贵州省科学技术基金项目(黔科合基础[2019]1113号);
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为了构建羊口疮病毒(Orf virus, OrfV)B2L-F1L截短融合基因,并对该基因序列进行生物信息学分析,试验采用DNAStar生物信息学软件分别对B2L、F1L基因序列进行分析,截取B2L、F1L基因序列的主要抗原区域,分别设计引物,利用重叠延伸PCR(SOE-PCR)技术对截取的B2L、F1L基因主要抗原区域进行融合,并与pMD-18T载体连接,构建重组质粒pMD18-T-B2L-F1L,经PCR鉴定、双酶切和测序验证正确后,应用生物信息学在线软件对B2L-F1L截短基因编码的蛋白质进行信号肽、跨膜结构、亲疏水性、柔韧性、抗原指数、抗原决定簇、糖基化结合位点、磷酸化结合位点、二级结构和三级结构进行预测。结果表明:构建的B2L-F1L截短融合基因大小约为1 080 bp,与预期目的片段大小相符;该蛋白有信号肽、无跨膜结构域,亲水性、抗原指数及柔韧性较好,有17个抗原决定簇,2个糖基化结合位点和28个磷酸化结合位点,二级结构中以α-螺旋和无规则卷曲占比较大。说明试验成功构建出羊口疮病毒B2L-F1L截短融合基因。
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