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比较了RAPD和AFLP标记技术在尼罗罗非鱼遗传多样性研究中的应用.共筛选20个RAPD引物和7个AFLP引物组合,检测到AFLP标记的有效等位基因数和平均多态信息量稍低于RAPD标记,但AFLP标记的多态性检测效率显著高于RAPD标记.两种分子标记所得遗传相似系数接近.结果表明:AFLP和RAPD适宜于基因组DNA检测,但AFLP优于RAPD.