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为了筛选黑麦染色体组特异性分子标记,以荆州黑麦、秦岭黑麦、森林黑麦、非洲黑麦、普通小麦中国春、R25、R111和MY11为材料,用A~M组142个10碱基随机引物进行RAPD扩增。发现引物M04可以在所有黑麦中扩出一条长1143bp(经测序)的特异片段OPM041143,而供试小麦材料均未扩出该片段。根据OPM041143设计特异引物M4-F和M4-R。利用M4-F和M4-R对含黑麦染色体的材料和小麦族其它物种进行扩增,结果表明,只有含黑麦染色体的材料均可以扩出一条分子量为1082bp的DNA带,命名为P