【摘 要】
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目的 分析肺癌间质表型亚系A3细胞中上皮间质转化(EMT)相关的miR-194-5p鉴定、分析及其靶基因功能富集的生物学过程和信号通路.方法 使用微流控芯片筛选母系肺癌A549细胞获得间质表型亚系A3细胞,利用miRCURYTM芯片筛选差异性表达的miRNA.利用MTT、Transwell实验检测miR-194-5p对亚系细胞增殖、迁移、侵袭能力的影响.应用Miranda、MiRBase、TargetScan数据库和DAVID在线软件对miR-194-5p进行靶基因预测及相关信号通路、生物学功能富集分析.
【机 构】
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中国医科大学卫生部细胞生物学重点实验室,医学细胞生物学教育部重点实验室,生命科学学院细胞生物学教研室,辽宁沈阳110122
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目的 分析肺癌间质表型亚系A3细胞中上皮间质转化(EMT)相关的miR-194-5p鉴定、分析及其靶基因功能富集的生物学过程和信号通路.方法 使用微流控芯片筛选母系肺癌A549细胞获得间质表型亚系A3细胞,利用miRCURYTM芯片筛选差异性表达的miRNA.利用MTT、Transwell实验检测miR-194-5p对亚系细胞增殖、迁移、侵袭能力的影响.应用Miranda、MiRBase、TargetScan数据库和DAVID在线软件对miR-194-5p进行靶基因预测及相关信号通路、生物学功能富集分析.结果 成功筛选获得具有间质表型亚系A3细胞,与母系A549细胞相比,在A3亚系中miR-194-5p的表达水平显著下调,转染miR-194-5p mimics后细胞迁移和侵袭能力发生显著降低但增殖未受影响;转染miR-194-5p inhibitor后细胞的迁移和侵袭能力增强.miR-194-5p的48个靶基因主要在蛋白质结合等生物学过程中起作用,信号通路显著富集于TGF-β等EMT相关信号转导通路.结论 从微流控芯片获得的间质表型细胞亚系成功筛选EMT相关miRNA,其中miR-194-5p抑制肺癌EMT进程,是潜在的治疗靶点.
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