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PCR—DGGE技术是现代分子生物学技术中一种很重要的分析手段，近年来在环境微生物领域发展迅速，与传统微生物培养鉴定方法相比，PCR—DGGE技术简便、快速、准确，并且对于难以培养的微生物也具有较好的分离效果，因此，在环境微生物领域中受到普遍重视。介绍了PCRDGGE技术的基本原理、影响因素，以及在厌氧反应器中的应用，并对其应用前景做了展望。