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对序列图像进行三维重建,通常采用外置标记进行图像配准。由于没有考虑因采集设备和环境因素而可能造成的图像畸变,对设备和环境要求较高,配准精度低。以人体大脑实体切片图像为对象,对基于外置标记图像配准方法加以改进。通过傅立叶卷积变换、双线性坐标变换对畸变象素用三次卷积法进行提取和重填充,得到高精度配准图像。实验表明,降低对采集系统的依赖性,提高图像的配准精度,具有广泛的适用性。