基于加权基因共表达网络分析法筛选多囊卵巢综合征Hub基因

来源 :遵义医科大学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:guxingyiren
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目的 多囊卵巢综合征(PCOS)常伴有肥胖表现,探索调控PCOS患者肥胖的关键基因,有益于肥胖型PCOS的诊断与防治。方法 从GEO数据库中下载肥胖型PCOS患者和肥胖非PCOS患者转录组数据,运用加权基因共表达网络分析法(WGCNA)筛选出与PCOS发生发展相关的关键模块,用GO及KEGG对模块功能进行富集分析,进一步挖掘出与PCOS发生发展相关联的中枢基因(Hub gene)。结果 WGCNA一共定义了13个基因共表达模块,从其中4个模块中筛选出与肥胖PCOS相关的189个差异表达基因,这些基因主要被富集到免疫相关的TNF-α和IL-17信号通路,从中最终筛选出PTGS2、IL6、CXCL8、CXCL2、IL1B、S100A9、S100A8、CCL2、ICAM1、LIF、TNFRSF1B和IRF1 12个Hub基因。结论 本研究筛选出与肥胖PCOS相关的关键基因,并进一步聚类到免疫相关信号通路,提示肥胖型PCOS与免疫应答存在相关性。
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