【摘 要】
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[目的]探讨趋化因子受体6 (chemokine receptor 6,CXCR6)对肺腺癌患者预后影响及潜在机制.[方法]下载癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库中肺腺癌患者的RNA
【机 构】
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武警特色医学中心军人全科医学科,天津300162;武警特色医学中心特勤急救外科,天津300162;武警后勤学院学兵二大队,天津300309
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[目的]探讨趋化因子受体6 (chemokine receptor 6,CXCR6)对肺腺癌患者预后影响及潜在机制.[方法]下载癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库中肺腺癌患者的RNA表达谱及临床数据,按照CXCR6表达水平分为高表达组(n=-246)和低表达组(n=246),比较两组患者生存时间;比较不同肿瘤分期患者的CXCR6表达水平;将患者所测的各个RNA表达水平逐一与CXCR6表达水平进行Pearson相关性分析,选取相关性最高的前50个基因;对筛选出的50个基因进行基因本体(gene ontology,GO)富集分析、京都基因与基因组百科全书通路(the kyoto encyclopedia of genes and genomes pathway,KEGG通路)富集分析以及所编码蛋白质之间的相互作用分析.[结果]CXCR6高表达组患者的中位生存时间长于CXCR6低表达组,差异有统计学意义(1 653 d vs.1 258d,P=0.013).根据病理分期分组,则四组间差异有统计学意义(F=3.793,P=0.010),其中Ⅲ期患者CXCR6表达水平低于Ⅰ期,Ⅳ期患者CXCR6表达水平低于Ⅰ-Ⅱ期的患者(P＜0.05).根据T分期分组,则四组间差异有统计学意义(F=7.555,P＜0.001),其中T1期患者CXCR6表达水平高于T2-T4期患者(P＜0.05).根据N分期或M分期分组,则四组间差异无统计学意义(P＞0.05).在检测的19 988个基因中,有5 159个基因与CXCR6存在相关性(P＜0.05),相关性最高的50个基因进行GO富集分析可见,主要涉及的生物学过程为对刺激的反应;主要定位的细胞组分为细胞膜;主要涉及的分子功能为蛋白质结合.KEGG通路富集分析可见主要涉及的信号通路为白细胞介导的细胞毒性正调控.CD3家族等淋巴细胞功能相关抗原及T细胞受体相关的跨膜适配器1 (T-cell receptor-associated transmembrane adapter 1,TRAT1)等靶蛋白是处于相互作用网络核心的蛋白.[结论]在肺腺癌患者中,CXCR6低表达者较高表达者预后更差,这可能与调节T细胞免疫功能有关.
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