基于高通量测序的中华鳑鲏基因组微卫星特征分析及标记开发

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利用Illumina Miseq测序技术,对中华鳑鲏基因组文库进行测序,查找基因组微卫星(SSR)位点并分析其组成,共检测到249167个SSR位点,1~6核苷酸重复SSR均存在,其中二核苷酸重复SSR数量最多(53.59%),其次为单核苷酸重复SSR(34.19%),其他数量由多到少依次为三核苷酸、四核苷酸、五核苷酸和六核苷酸重复。随机选择50个SSR位点利用8份中华鳑鲏DNA样品进行验证,有41个位点能检测到扩增产物,其中28个位点扩增产物带型清晰且具多态性,利用上述多态性SSR标准检测泰州地区中华鳑
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