3’端锚定随机引物检测与鉴定未知DNA病毒方法研究

来源 :华南预防医学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:yangtianmei03
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目的建立一种用3’端锚定随机引物检测与鉴定未知DNA病毒核酸的方法。方法将本实验室分离到的1株DNA病毒分离物用过滤器过滤后,加入适当的核酸酶消化,提取消化物中的病毒核酸,分别用3’锚定随机引物RP1和RP2对上述病毒核酸进行PCR扩增,凝胶电泳并纯化该PCR产物,纯化后的PCR产物与T载体连接并转入JM109感受态细胞,蓝白斑筛选挑选阳性克隆进行测序,登录NCBI网站,利用BLAST软件进行序列比对和确认。结果凝胶电泳显示2种3’端锚定随机引物PCR产物大小均在500bp以上,并呈涂布状,RP1的PCR产物较RP2小;分别挑取RP1和RP2随机引物PCR产物克隆各7个,分别有6、2个克隆携带有目的病毒核酸片段,挑取上述8个阳性克隆进行测序,其中获得500bp以上的序列7条,500bp以下序列1条,其中最长的达741bp,最短的398bp;序列分析证实这些片段均与腺病毒2型同源性最高,同源性高达98%~99%。结论 RP1和RP2引物均能成功鉴定目标病毒,且RP1较RP2具有更高的扩增效率和敏感性。初步建立一种利用3’端锚定随机引物检测与鉴定未知DNA病毒的方法。
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