部分蔬菜CMV分离物CP基因的克隆及序列分析

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对来自国内不同地区、不同蔬菜作物上的8个黄瓜花叶病毒分离物,采用一步法RT-PCR扩增得到CP基因全长片段,分别克隆到pMD-18T载体并测序。结果表明,本研究8个分离物的CP基因均为657个碱基,可编码218个氨基酸,它们之间的核苷酸序列同源性较高,达92·8%~99·1%;将它们与GenBank中部分CMVCP基因序列比较,显示出与CMV亚组Ⅰ株系的核苷酸序列同源性达90·7%~98·0%,而与亚组Ⅱ株系的核苷酸序列同源性仅有75·8%~78·1%。因此,这8个分离物应归属于CMV亚组Ⅰ。 Eight cucumber mosaic virus isolates from different regions and different vegetable crops in China were amplified by one-step RT-PCR and cloned into pMD-18T vector and sequenced. The results showed that the CP genes of the 8 isolates in this study were all 657 bases, encoding 218 amino acids. The nucleotide sequences of these 8 isolates were highly homologous (92.8% -99.1%). Comparing them with some of the CMVCP gene sequences in GenBank showed that the nucleotide sequences of CMV subunit Ⅰ were 90.7% -98.0% Sequence homology is only 75.8% ~ 78.1%. Therefore, these eight isolates should be assigned to CMV subgroup I.
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