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利用一种新的分子标记SRAP技术对17个莲藕品种进行了DNA多态性分析。选取7对引物扩增基因组DNA，共获得168条带，其中159条为多态性条带，每对引物平均提供24个标记信息。由UPMGA方法得到的聚类分析结果表明了17个品种间的遗传关系：（1）亚洲莲与美洲莲之间有明显的差异；（2）在亚洲莲内部，藕莲和花莲有明显的遗传分化，在花莲内部亚洲莲与美洲莲的杂交后代和其它花莲品种之间存在明显的差异；（3）SRAP标记是作分子图谱的好标记，但很难区分遗传关系较近的品种。