目的探讨细菌耐药机制指导在抗生素合理应用中的临床价值。方法选取常州市第一人民医院住院部2015年8月—2016年1月收治的患者5764例,并选取2016年2—7月收治的患者5506例。2016年2月,本院实施"基于细菌耐药机制指导临床抗生素的合理应用改进活动",比较改进前后医院感染管理质量指标(医院感染发生率、多重耐药菌检出率、医院感染病原学开展率、抽检的住院抗生素处方不合理用药率、联合用药率、高耐药可能性药物使用率)及临床医师抗生素合理应用知识(耐药机制、耐药可能性药物与划分、药物轮替制度、病原学诊断指导意义、药物动力学检测指导意义)掌握程度。结果改进后医院多重耐药菌检出率、医院感染病原学开展率、抽检的住院抗生素处方不合理用药率、联合用药率、高耐药可能性药物使用率低于改进前(P<0.05)。改进后临床医师耐药机制、耐药可能性药物与划分、药物轮替制度、药物动力学检测指导意义评分及总分高于改进前(P<0.05)。改进前后,临床药师对病原学诊断指导意义评分比较,差异无统计学意义(P>0.05)。结论细菌耐药机制指导在抗生素合理应用中的应用价值确切,可提高医院感染,特别是耐药菌感染的防控水平。