油菜EST资源的SSR信息分析

来源 :中国油料作物学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:huangping118
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从NCBI公共数据库获得63334条油菜EST,通过前处理得到全长为12165.38kb的无冗余EST17987条。在这些序列中搜索出2803个SSR,分布于2443条EST中,出现频率是15.58%。这些EST—SSR的平均长度为18.84bp,平均分布频率是1/4.34kb。二核苷酸重复和三核苷酸重复是主要的类型,二者出现的频率基本相近,占总SSR的89.05%。AG/CT和AAG/CTT是二、三核苷酸中的优势重复类型,分别占二、三核苷酸重复的84.04%和35.7I%,同时对这些SSR的可用性进行了
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