目的应用实时荧光定量-聚合酶链反应(RT-PCR)方法,分别对胃窦和胃体部进行幽门螺杆菌(Hp)鉴定及其对克拉霉素耐药基因突变检测,以了解同一患者不同部位Hp感染及耐药情况,更好地为临床用药提供指导。方法选取60例功能性消化不良,且经14C呼气试验确诊Hp阳性的患者,经胃镜分别在胃窦及胃体部采样活检,采用RT-PCR方法对此120例标本Hp感染情况进行鉴定,随后对Hp阳性的标本进行克拉霉素耐药基因A2142G和A2143G突变情况检测。结果 120例标本中有116例Hp阳性,其中胃窦部56例(93.3%),胃体部60例(100%),有4位患者(6.7%)不同部位Hp感染的鉴定结果不一致。在116例Hp阳性标本中,48例(41.4%)为野生型,67例(57.8%)为突变型,1例(0.9%)同时存在野生型及A2143G、A2142G突变型。在67例耐药Hp中,47例为A2143G纯合突变,18例为A2143G杂合突变,2例为A2142G纯合突变。在56位胃窦和胃体Hp感染均为阳性的患者中,有7位患者(12.5%)不同部位Hp对克拉霉素耐药基因突变存在差异,主要为A2143G纯合与杂合突变间的差异(5/7),敏感与耐药间的差异(1/7),以及混合感染与单纯耐药间的差异(1/7)。结论使用RT-PCR方法将胃窦及胃体两个典型部位分别进行Hp相关检测,可提高Hp的检出率,且有助于正确判断Hp的存在部位以及耐药Hp的突变位点和类型,进而优化临床治疗方案,指导抗菌素的选择,从而提高Hp的根除率。