目的 分析液基细胞学对消化系统肿瘤的诊断效能。方法 回顾性收集2019年9月至2021年1月我院经影像学检查疑似消化系统肿瘤而进行液基细胞学和传统细胞学检查的80例患者的病历资料，根据内镜活检结果将患者分为分析组和对照组，分析组患者确诊为消化系统恶性肿瘤，共60例；对照组患者确诊为消化系统良性肿瘤，共20例。分析液基细胞学、传统细胞学对消化系统恶性肿瘤的诊断结果，分析液基细胞学对消化系统恶性肿瘤分型的诊断价值。结果 液基细胞学对消化系统恶性肿瘤的诊断灵敏度为88.33%（53/60），特异度为75.00%（15/20），阳性预测值为91.38%（53/58），阴性预测值为68.18%（15/22），准确度为85.00%（68/80）。传统细胞学对消化系统恶性肿瘤的诊断灵敏度为83.33%（50/60），特异度为70.00%（14/20），阳性预测值为89.29%（50/56），阴性预测值为58.33%（14/24），准确度为80.00%（64/80）。液基细胞学诊断腺癌的准确度为96.30%（26/27），诊断鳞状细胞癌的准确度为89.47%（17/19），诊断神经内分泌癌的准确度为80.00%（8/10），诊断淋巴瘤的准确度为50.00%（1/2），诊断间质瘤的准确度为50.00%（1/2）。结论 液基细胞学诊断消化系统恶性肿瘤的临床价值高于传统细胞学，且其对腺癌、鳞状细胞癌以及神经内分泌癌分型的诊断准确度较高。