【摘 要】
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[目的]沙棘Hippophae rhamnoides根瘤中拥有丰富的微生物资源,探究根瘤内生菌微生物多样性,比较高通量测序与纯培养方法的优劣.[方法]运用16S rRNA高通量测序技术探究沙棘根瘤内生菌相对丰度和多样性差异,并对根瘤内生菌进行分离纯培养,以完成内生菌株库初步构建.[结果]①传统分离方法得到纯培养菌株96株,共4门8纲8目13科19属.在门分类水平上,相对丰度较高的主要为变形菌门Proteobacteria和厚壁菌门Firmicutes.②高通量测序分析6组样品(M1～M6)中共有14门34
【机 构】
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中国林业科学研究院 林业研究所 国家林业和草原局林木培育重点实验室,北京 100091;中国林业科学研究院 林业研究所 国家林业和草原局林木培育重点实验室,北京 100091;南京林业大学南方现代林业
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[目的]沙棘Hippophae rhamnoides根瘤中拥有丰富的微生物资源,探究根瘤内生菌微生物多样性,比较高通量测序与纯培养方法的优劣.[方法]运用16S rRNA高通量测序技术探究沙棘根瘤内生菌相对丰度和多样性差异,并对根瘤内生菌进行分离纯培养,以完成内生菌株库初步构建.[结果]①传统分离方法得到纯培养菌株96株,共4门8纲8目13科19属.在门分类水平上,相对丰度较高的主要为变形菌门Proteobacteria和厚壁菌门Firmicutes.②高通量测序分析6组样品(M1～M6)中共有14门34纲89目148科314属.在门分类水平上,相对丰度较高的主要为放线菌门Actinobacteria和变形菌门,两者相对丰度之和为87.50％～97.10％.在属的分类水平上,弗兰克氏菌属Frankia占绝对优势,相对丰度为20.12％～74.81％,平均相对丰度为51.49％.③高通量测序与纯培养方法的结果有明显差异,在科和属的分类单元上差异较大.[结论]2种方法都体现沙棘根瘤内生菌的多样性,但纯培养方法仅能够分离到部分内生菌,难以评估物种组成及相对丰度.高通量测序分析能够更为全面地反映多样性信息,且为优化纯培养条件而分离特定物种奠定基础.
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