【摘 要】
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为进一步探究稻米外观品质分子调控机制,挖掘新的环境钝感型主效QTL,本研究以\'屉锦\'和\'北陆129\'杂交衍生的回交重组自交系(BIL)和染色体片段代换系(CSSL)群体为试验材料,对稻米外观品质进行QTL鉴定.结果显示,双亲外观品质存在明显差异,\'屉锦\'整精米率较高、垩白少和粒型短圆,外观品质性状间存在明显的相关性.BIL群体检测到32个调控外观品质的QTL,15个QTL稳定表达;CSSL群体鉴定了16个相关QTL,主效QTL在不同群体中共性表达;QTL成簇分布于第1、
【机 构】
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江西省农业科学院水稻研究所,国家水稻改良中心南昌分中心,水稻国家工程实验室,南昌, 330200;沈阳农业大学水稻研究所,沈阳, 110161;沈阳农业大学水稻研究所,沈阳, 110161;江西省农业
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为进一步探究稻米外观品质分子调控机制,挖掘新的环境钝感型主效QTL,本研究以\'屉锦\'和\'北陆129\'杂交衍生的回交重组自交系(BIL)和染色体片段代换系(CSSL)群体为试验材料,对稻米外观品质进行QTL鉴定.结果显示,双亲外观品质存在明显差异,\'屉锦\'整精米率较高、垩白少和粒型短圆,外观品质性状间存在明显的相关性.BIL群体检测到32个调控外观品质的QTL,15个QTL稳定表达;CSSL群体鉴定了16个相关QTL,主效QTL在不同群体中共性表达;QTL成簇分布于第1、2、3、8、9和11染色体上,6个区段包含30个位点,占QTL总数的62.50%,其中主效QTL簇qAQ1、qAQ8和qAQ9在不同群体与环境下效应明显、重演性较好,是进一步深入研究的“热点”区域.这将进一步丰富外观品质性状的分子调控机理,也为主效QTL簇的精细鉴定提供坚实基础.
其他文献
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为了探讨Hog1基因在油茶果生刺盘孢菌(Colletotrichum fructicola)致病过程中的作用.本研究以酿酒酵母中的Hog1基因为依托,进行BlAsTP比对分析油茶果生刺盘孢菌的全基因组数据,以获取与其高度同源的Hog1蛋白序列,通过对ATMT体系进行改进和调整,建立了炭疽病菌基因敲除体系.采用形态观察、显微鉴定、生物学表型分析方法,基于科赫法则(Koch postulates),检测病原菌的致病力大小.结果表明,本试验成功敲除了C.fructicola野生型菌株CFLH16 Hog1基因,
水杉(Metasequoia glyptostroboides)是著名的杉科孑遗植物,对水杉的分子遗传研究在其资源保护和利用方面具有重要意义.本研究以水杉为实验材料,在全长转录组测序的基础上克隆了一个泛素结合酶基因(MgUC-E2),并进一步对该基因作了生物信息学分析.结果表明:MgUC-E2基因cDNA编码链全长为691 nt,可以编码长度为148个氨基酸的泛素结合酶.该酶蛋白的分子量为16545.09 kD,等电点为7.72,平均吸水值为-0.343;含有15个磷酸化修饰位点和5个常见功能位点;在预测
为进一步明确浙江省常规晚粳稻品种中稻瘟病抗性基因的分布情况,本研究利用Pi2、Pi9、Pi5、Pi40、Pib、Pita、Pi25、Pi41、Pikm和Pigm 10个抗瘟基因的功能标记,对12个常规晚粳稻主栽品种进行分子标记检测.结果表明,Pib、Pi25、Pi40和Pi41等4个抗性基因在这些供试品种中的分布频率高达100%;Pi2和Pikm的分布频率均为58.33%,Pita、Pi5、Pi9和Pigm的分布频率分别为50.00%、33.33%、25.00%和0;12个供试水稻品种中,\'浙粳29
本研究的目的是克隆白花泡桐纤维素生物合成途径关键酶基因——纤维素合成酶家族基因.采用PCR和RACE技术,利用Oligo、Primer Premier 5等软件进行引物设计,从白花泡桐中克隆出纤维素合成酶基因一条,NCBI分析后,命名为PfCesA4(NCBI登录号:MK340936).PfCesA4基因的cDNA全长为3735 bp,其开放阅读框(ORF)长度为3138 bp,能够编码含有1045个氨基酸的蛋白质,此蛋白质的相对分子质量为119081.91 u,等电点为7.24.二级结构分析表明其以α-
查尔酮合酶(chalcone synthase,CHS)是艾纳香(Blumea balsamifera DC.)黄酮类化合物代谢途径的关键酶之一.本研究以产自贵州省罗甸县道地艾纳香为研究材料,参照艾纳香叶的转录组数据,设计PCR引物,成功克隆得到查尔酮合成酶基因的完整cDNA序列,利用生物信息学分析软件对其进行相关分析,包括氨基酸性质、信号肽、跨膜域、多序列比对、进化树构建以及蛋白的二、三级结构预测等,并且构建了CHS原核表达载体,在BL21宿主菌中可以表达目的蛋白,为黔产艾纳香中CHS的生物学研究提供依
为了研究枣树枣疯病发生的分子机理,基于边合成边测序技术,本研究使用Illumina高通量测序平台对健康及感病的木枣树叶片进行转录组测序分析.经过测序质量控制,共得到Clean Data 55.17 Gb,各样品Clean Data平均为6.13 Gb,GC%含量为45.43%,Q30>93.63%,与参考基因组的比对效率在78.41%~85.77%之间,共发掘1909个新基因.样品间共筛选出9593个差异表达基因,其中上调基因有6199个,下调基因有3394个.同时,还预测出1298个转录因子,归于55类
本研究以转入甜菜碱醛脱氢酶基因(badh)的玉米自交系\'丹988\'的T7代自交系为试验材料,利用断水及盐溶液分别模拟干旱胁迫与盐碱胁迫,对转基因材料进行苗期的抗旱性与耐盐碱性鉴定.鉴定结果表明,在抗旱性试验中,断水15 d、断水20 d时转基因玉米自交系各项抗旱指标数值普遍高于对照,且大部分存在显著性差异;在断水25 d时转基因玉米自交系与对照的全部抗旱指标存在显著性差异.在耐盐碱试验中,在胁迫20 d、30 d、40 d时丹988-BADH红-1、丹988-BADH红-2各项耐盐碱指标数值普
芒(Miscanthus sinensis)隶属于多年生高大禾草——芒属(Miscanthus),其生态效应和经济效益备受国内外研究者的关注,是中国广阔边际土地种植与利用的能源植物.为获得芒的转基因株系,同时对MINAC2基因在盐胁迫下的表达特征进行研究,本研究利用农杆菌介导法将MINAC2基因导入芒的基因组,并采用RT-qPCR技术测定了0.6%NaCl溶液胁迫下转基因株系0、1 h、3 h、9 h、12 h、24 h、48 h的MINAC2相对表达量.获得的主要研究结果如下:(1)经PCR鉴定确定了转
毛葡萄叶片中含有大量多糖、多酚等多种次生代谢物,严重影响RNA提取质量,筛选从毛葡萄叶片中提取高质量RNA的方法是开展相关分子研究的基础.本研究采用改良CTAB法、改良SDS/酚法和三种试剂盒法,筛选适合转录组测序的提取毛葡萄叶片总RNA的方法.结果显示,五种方法均可以获得毛葡萄叶片总RNA,但在纯度和完整性上差别较大.改良CTAB和改良SDS/酚法提取的总RNA OD260/OD230比值小于1.8,试剂盒A法提取的总RNA在纯度和完整性上均可以满足转录组测序要求,试剂盒B法和试剂盒C法提取的总RNA降