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现行Barrett食管的治疗方法主要是抑酸药物治疗和外科食管切除术，但前者只能控制反流症状．不会减少Barrett食管发生癌变的危险性，后者有一定的风险和手术致死率，年龄超过70岁死亡率增加到11％，此外病人要在术后至少9个月才能达到术前生活质量，具有一定的手术禁忌症。近年来出现了一些内镜治疗技术，如EMR、光动力治疗、APC等。