【摘 要】
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应用SSU rDNA和线粒体cox 1序列研究甲藻(Dinoflagellate)中不同生态类群的演化关系。通过PCR扩增和测序获取4株甲藻SSU rDNA及其线粒体cox 1部分片段,结合GenBank中24株甲藻的
【机 构】
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上海海洋大学水产与生命学院,国家海洋局东海环境监测中心
【基金项目】
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上海市优秀学科带头人计划项目(08XD1403700), 上海市科委国际合作项目(08540702600),上海市科委农业重点攻关项目(10391901900), 海洋公益性行业科研专项经费(200905010), 国家海洋局重点实验室开放研究基金资助项目(MATHAB200907)
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应用SSU rDNA和线粒体cox 1序列研究甲藻(Dinoflagellate)中不同生态类群的演化关系。通过PCR扩增和测序获取4株甲藻SSU rDNA及其线粒体cox 1部分片段,结合GenBank中24株甲藻的相关序列,以Plasmodium falciparum为外群,构建ML树和NJ树,并采用自展支持度评估进化树分支结构,通过计算后验概率评估进化树整体结构,应用1sKH、SH、ELW和2sKH等方法评估两株ML树间的拓扑结构。结果显示,在由上述两序列构建的进化树上,底栖原甲藻均未与浮游原甲藻聚
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