金针菇实时荧光定量PCR内参基因的筛选

来源 :食用菌学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：supergirl

【摘要】

：

基于金针菇(Flammulina filiformis)基因组和转录组的测序组装结果,选取13个内参基因(α-TUB、β-TUB、PGM、RPL19C、RPL6、CYC、18S rRNA、Vha68、ACT、GPD、PAS、TEF和VSN)

【作者】

：

武晨剑袁学文宋淋浩常明昌刘靖宇邓冰孟俊龙

【机构】

：

山西农业大学食品科学与工程学院,山西省食用菌工程技术研究中心

【出处】

：

食用菌学报

【发表日期】

：

2021年1期

【关键词】

：

金针菇 △Ct算法 NORMFINDER BestKeeper GENORM Flammulina filiformis △Ct NormFinder Best

【基金项目】

：

国家自然科学基金(32072647),2019年山西省研究生教育创新资助项目(2019SY207),山西省煤基重点科技攻关项目(FT2014-03-01)

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基于金针菇(Flammulina filiformis)基因组和转录组的测序组装结果,选取13个内参基因(α-TUB、β-TUB、PGM、RPL19C、RPL6、CYC、18S rRNA、Vha68、ACT、GPD、PAS、TEF和VSN),通过设计跨内含子引物,分别对金针菇不同菌株(Fy331、Fw12、川金10、Fv296、金黄11和福建白金)菌丝和Fy331菌株不同发育阶段(菌丝、原基、幼嫩子实体和成熟子实体)样品进行实时荧光定量PCR(quantitative real time polymera

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