目的:基于GEO数据库初步分析健康人和哮喘患者气道平滑肌细胞的差异表达基因,为治疗哮喘提供更多的可能.方法:检索GEO数据库中关于哮喘患者气道平滑肌细胞的相关基因芯片数据(Microarray),借助R语言分析差异基因,利用DAVID数据库对关键差异基因进行GO富集分析和KEGG通路分析,构建差异基因蛋白质-蛋白质相互作用关系(PPI)网络,拓扑筛选关键的差异表达基因.结果:检索GEO数据库确定序列号为隶属于GPL6224平台的GSE35643和GSE63383芯片和隶属于GPL6480的GSE34313芯片,利用R语言分析筛选出不同处理组的差异基因,通过DAVID在线功能富集分析关键差异基因,显示GO富集主要表现为巨噬细胞细胞因子生成的正向调控、细胞黏附、缺氧的反应、成纤维细胞生长因子受体信号通路的负向调控、炎症反应的正向调控、白细胞介素-6生成的正向调控、膀胱发育、肺发育、ERK1和ERK2级联、细胞骨架构建、肌动蛋白丝聚合的正向调控等;在KEGG通路富集层面主要集中在肾素分泌、ABC转运体、补体和凝血级联、轴突引导蛋白质的消化和吸收、PPAR信号通路、黏蛋白型O-聚糖生物合成、细胞因子与受体的相互作用、肥厚型心肌病、脂肪酸代谢、细胞周期、以及Hippo信号通路等;通过String数据库构建PPI,以MCC权重≥3为标准,在各处理组共拓扑筛选出52个关键差异基因;将不同数据集中获得的差异基因进行比对,最终得出4个在所有样本中均有表达差异的关键基因:前列腺素内过氧化物合成酶2(PTGS2)、骨形态发生蛋白4(BMP4)、透明质酸合酶2(HAS2)、肿瘤坏死因子配体超家族成员4(TNFSF4).结论:PTGS2、BMP4、HAS2和TNFSF4可能在哮喘的发病过程中发挥着重要作用.