基于网络药理学与分子对接技术的鲜竹沥治疗“咳、喘、痰”机制及其质量标志物预测分析

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目的应用网络药理学和分子对接方法,对鲜竹沥发挥"咳、喘、痰"作用的机制及潜在的质量标志物(quality marker,Q-Marker)预测分析。方法采用干馏法和火烤法制备鲜竹沥,对鲜竹沥的指纹图谱进行研究,筛选并预测其中14个成分的潜在作用靶点及通路,结合文献数据库分析确定"咳、喘、痰"病症的靶基因;取药物与疾病交集基因,将交集基因上传String数据库进行蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)分析,利用Rstudio的clusterProfiler功能对交集基因进行基因本体(gene ontology,GO)功能及京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析;预测鲜竹沥的Q-Marker,并运用分子对接软件对部分关键靶点及其对应成分进行分子对接,验证网络分析结果。结果采用指纹图谱研究得到8批干馏法、火烤法的鲜竹沥主要活性成分,经网络药理学及分子对接分析鲜竹沥对"咳、喘、痰"病症的治疗作用,推测鲜竹沥的Q-Marker为香草酸、对乙基苯酚、丁香醛、二氢丁香酚、对乙烯基愈创木酚,主要通过调节炎症反应、环磷酸腺苷(cyclic adenosine monophosphate,c AMP)信号通路、缺氧诱导因子-1α(hypoxiainducible factor-1α,HIF-1α)信号通路、血管内皮生长因子(vascular endothelial growth factor,VEGF)信号通路等重要生物通路来发挥止咳、平喘、化痰的作用。结论通过预测鲜竹沥的Q-Marker,为提升其质量控制标准奠定了基础,同时也为鲜竹沥功效关联物质的研究及作用机制的阐释提供参考,为其二次开发以及扩大临床使用范围提供参考依据。
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