【摘 要】
：
为探讨海南岛的小泡巨鼠肠道微生物群落组成及其菌群多样性。2019年12月于海南医学院-香港大学热带传染病联合实验室提取25只海南岛的成年小泡巨鼠（14只雄和11只雌性）粪便样本DNA，基于IonS5TMXL测序平台，利用单端测序（Single-End）的方法，构建小片段文库进行单端测序。通过对测序片段剪切过滤，操作分类单元（Operational Taxonomic Units，OTUs）聚类，利用mothur方法与SSUrRNA数据库对OTUs进行物种注释及丰度分析，并进一步开展α多样性分析（Alpha
【机 构】
：
海南医学院热带病转化医学教育部重点实验室 海南医学院-香港大学热带传染病联合实验室 海南医学院病原生物学教研室，海口571101;三亚市人民医院检验科，三亚572000;北京大学首钢医院检验科，北京1
论文部分内容阅读
为探讨海南岛的小泡巨鼠肠道微生物群落组成及其菌群多样性。2019年12月于海南医学院-香港大学热带传染病联合实验室提取25只海南岛的成年小泡巨鼠（14只雄和11只雌性）粪便样本DNA，基于IonS5TMXL测序平台，利用单端测序（Single-End）的方法，构建小片段文库进行单端测序。通过对测序片段剪切过滤，操作分类单元（Operational Taxonomic Units，OTUs）聚类，利用mothur方法与SSUrRNA数据库对OTUs进行物种注释及丰度分析，并进一步开展α多样性分析（Alpha Diversity）和β多样性分析（Beta Diversity）。结果显示，从25只小泡巨鼠肠道粪便样本中共得到高质量序列1481842条，归属为14个门、85个科、186个属。从门分类水平上，小泡巨鼠的主要核心生物群有厚壁菌门（Firmicutes，46.04%），拟杆菌门（Bacteroidetes，25.34%）；随后依次为变形菌门（Proteobacteria，17.09%），柔壁菌门（Tenericutes，7.38%），放线菌门（Actinobacteria，1.67%）；这5个门占所有菌门的97.52%。属水平上螺杆菌属（n Helicobacter）所占比例最大，为12.44%；其次为乳杆菌属（n Lactobacillus，11.39%），梭菌属（n Clostridium，6.19%），支原体属（n Mycoplasma，4.23%），黄杆菌属（n Flavonifractor，3.52%）。综上，高通量测序分析表明海南岛小泡巨鼠肠道菌群结构复杂，菌种多样，具有进一步研究的意义。n “,”To explore the composition and diversity of the intestinal microflora of Leopoldamys edwardsi in Hainan Island. In November 2019, DNA was extracted from fecal samples of 25 adult Leopoldamys edwardsi (14 males and 11 females) in Hainan Island at the Joint Laboratory of tropical infectious diseases of Hainan Medical College and Hong Kong University. Based on the IonS5TMXL sequencing platform, single-end sequencing (Single-End) was used to construct a small fragment library for single-end sequencing. Based on Reads shear filtration and OTUs clustering. The species annotation and abundance analysis of OTUs were carried out by using mothur method and SSUrRNA database, and further conducted α diversity and β diversity analysis. A total of 1481842 high quality sequences, belonging to 14 Phyla, 85 families and 186 Genera, were obtained from 25 intestinal excrement samples of Leopoldamys edwardsi. At the level of phyla classification, the main core biota of the Leopoldamys edwardsi contained Firmicutes (46.04%),Bacteroidetes (25.34%), Proteobacteria (17.09%), Tenericutes (7.38%) and Actinobacteria (1.67%), these five phyla account for 97.52% of all phyla. The ratio of n Helicobacter which occupied the largest proportion at the genus level was 12.44%, followed by n Lactobacillus (11.39%), n Clostridium (6.19%),n Mycoplasma (4.23%) and n Flavonifractor (3.52%). High throughput sequencing analysis showed that the intestinal flora of Leopoldamys edwardsi in Hainan Island was complex and diverse, which had the significance of further research.n
其他文献
目的:对2016年新疆发生的一起食源性疾病的暴发进行流行病学调查及分子溯源分析。方法:2016年4月3日，新疆某地发生一起食源性疾病暴发事件。依据《食品安全事故流行病学调查指南（2012版）》，共发现142例病例，其中疑似病例138例、确诊病例4例。通过入户调查、面对面访谈的方式进行问卷调查，收集人口学信息、发病和诊疗情况、发病前3 d的饮食史和饮水史、食品的污染源等信息，并采集病例呕吐物及粪便、剩余冰激凌、加工冰激凌剩余牛奶及其他原料、牛奶供应站的牛奶等27份样本，采用脉冲场凝胶电泳（PFGE）和全基因
目的:探讨2017—2019年我国炭疽流行特征及发病规律，对部分省份（自治区）的炭疽芽胞杆菌进行分子分型分析。方法:收集中国疾病预防控制传染病监测信息系统和突发公共卫生事件报告管理信息系统中2017—2019年报告的炭疽发病资料，采用描述性流行病学方法分析流行特征和时间、地区及人群分布情况；以2017—2019年分离的47株炭疽芽胞杆菌作为研究对象，应用经典单核苷酸多态性分析（canSNP）和15个位点的可变数量串联重复序列分析（MLVA15）方法对炭疽芽胞杆菌进行分子分型分析。结果:2017—2019年
2020年石家庄城区PMn 2.5的质量浓度为（80.30±71.43）μg/mn 3；各金属、类金属间的Spearman相关性分析结果显示，Sb与Cd、Pb、Ni、Se，Cd与Pb、Ni、Se，Pb与Ni、Se，Ni与Se，Se与Tl呈正相关，相关系数大于0.5。PMn 2.5的金属、类金属主要来源有交通排放、燃料燃烧、金属冶炼和扬尘。健康风险评估结果显示，Pb、Hg 和Mn对各人群产生的n HQ值均小于1，非致癌风险较低；Ni和Cd对各人群产生的致癌风险n
北京市卢沟桥棚户区改造安置房项目西南,与地块平行方向有铁路及14号线西段,边界距地铁约160 m,距铁路约200 m.列车及地铁经过时均会产生振动和噪声,对建成后的住宅造成影响.为此测试铁路及地铁对地块的振动影响强度,并对测试结果进行分析,为建成的建筑提出可行的振动控制方案.
人类目前依然面临着细菌性传染病带来的公共卫生挑战。开展系统的传染病监测预警是预防和控制传染病最直接的手段。病原学是传染病监测预警的重要组成部分。敏感准确的病原学监测可以在第一时间识别病原、识别暴发、识别来源。本研究对细菌性传染病的病原学监测预警技术研究和应用现状进行综述，总结病原学在传染病监测预警中的重要性和应用场景以及病原学监测预警技术研究进展，并在我国现有的国家致病菌识别网等实验室监测网络的工作基础上，提出了传染病实验室网络化监测发展趋势和展望，为建立健全传染病监测预警体系提供参考。“,”Human
分析新疆巴音郭楞蒙古自治州一起肉毒梭菌食物中毒事件，探究中毒事件发生原因，明确诊断，为临床治疗提供技术支持。应用食品安全事故流行病学方法调查食物中毒事件中病例的基本信息、临床表现，采集自制腐乳和粪便灌洗液，经增菌培养后应用实时荧光定量PCR法检测样本中肉毒毒素编码基因，并进行菌株分离、纯化。对分离到的5株肉毒梭菌经肉毒毒素检测和基因检测验证后，进一步进行PFGE分型。此次中毒事件中2份自制腐乳和3例患者的粪便灌洗液标本均分离到A型肉毒梭菌，并得到了毒素检测和基因检测验证，5株肉毒梭菌的PFGE图谱DNA同
患者男性，34岁。因发现右眼眼球发白1个月余，就诊于合肥爱尔眼科医院。眼部检查：右眼视力为无光感，眼压为16 mmHg（1 mmHg=0.133 kPa），结膜充血，角膜透明，晶状体混浊，全脱位于前房中央，虹膜纹理不清（精粹图片1中A），玻璃体和眼底窥不入。眼前节相干光层析成像术检查结果见精粹图片1中B。B超检查结果提示右眼视网膜脱离。临床诊断：右眼晶状体全脱位；右眼并发性白内障；右眼陈旧性视网膜脱离。
海口塔巨型斜撑采用无支撑分段吊装的方法施工,其倾覆力矩由辅助拉杆承受,因此掌握拉杆的应力变化是设计和核算整个结构体系安全性至关重要的环节.而在上、下节斜撑对接过程中,对接口受力状态非常复杂,上节斜撑对下节斜撑的作用力很难利用现有的有限元计算软件建模计算.需要根据经验判断构件相对运动趋势,并以此为基础建立合理的力学模型,计算出上、下节斜撑从开始接触到达到设计位置过程中相互之间作用力的变化,进而计算出拉杆的应力变化.以应力应变计实测拉杆的应力,对计算结果进行检验.
随着我国经济的快速发展,相关部门逐步重视高空心薄壁墩墩身的施工及控制工作.为提升施工质量,则以济源至洛阳西高速公路第三标段为案例,了解该段高空心薄壁墩墩身施工中存在的问题,从施工原材料把控、攀爬模板安装以及施工人员素养提升等多层面采取针对性的措施解决对应的问题,并得出在控制施工影响因素基础上可将施工质量控制住,规避一些潜在的安全风险.
患者女性，85岁。因左眼视物模糊1年，就诊于解放军总医院眼科医学部。既往近视眼病史70余年，高血压病史10余年，退休前为核武器研究工作者。眼部检查：左眼裸眼视力为0.02，矫正无提高，光定位准确；眼压为24 mmHg（1 mmHg=0.133 kPa），角膜透明，前房深度正常，房水清，房角开放，全周房角散在灰白色碎屑样物质沉积，小梁网色素分级为Ⅰ~Ⅱ级（精粹图片1中A），虹膜震颤，瞳孔圆，直径约3.0 mm，直接及间接对光反应灵敏，无相对性传入性瞳孔功能障碍，瞳孔缘可见灰白色碎屑样物质沉积（精粹图片1中B