目的:对2010-2012年新疆地区医疗卫生机构基本药物使用现况进行研究分析并提出应对策略和建议。方法:以新疆地区各级医疗卫生机构为调查对象,采用文献资料法、访谈法、问卷调查法相结合的研究方法,对新疆地区各级医疗卫生机构基本药物的政策法规执行情况、基本药物的配送和使用情况等进行调查研究及分析。结果:新疆地区各级医疗卫生机构对基本药物相关政策法规掌握及执行情况较好,基本药物采购人员及软硬件配备水平有待于提高,部分基层医疗卫生机构对执行基本药物制度后的补偿机制信心不足。各级医疗卫生机构基本药物销售金额和品种数量所占比例呈逐年升高趋势。基层医疗卫生机构采购计划周期、协议结算周期、结算支付方式未严格按照制度规定要求执行。目前该区在违约处理方式上未形成有效、统一的制约机制。结论:基层医疗卫生机构对补偿机制信心不足、基本药物配送不及时及结算支付方式不统一等因素会导致基层医疗卫生机构基本药物配置不足,降低基本药物的可获得性,影响基层医疗卫生机构功能的发挥和"双诊制"的建立,创新医疗卫生机构基本药物采购模式、建立科学合理的基本药物配送企业评价标准、加强对基本药物配送环节的动态监管和配送流程的合理优化等措施可保障基本药物的配置与使用,有利于提高基本药物的可获得性,满足基本医疗需求,降低医疗费用,促进合理用药。