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目的
对一株发热伴血小板减少综合征布尼亚病毒(SFTSV)浙江分离株进行全基因组测序和分子进化分析。
方法从浙江省CDC采集1例SFTSV感染疑似病例的急性期全血标本，提取标本的病毒RNA并用荧光定量RT-PCR方法检测，分离得到SFTSV分离株。RT-PCR扩增覆盖全基因组的17个重叠基因片段，使用Geneious基因分析软件对测序结果进行剪辑和拼接。从GenBank数据库中获取各地SFTSV全基因组序列，采用RAxML软件及MEGA软件对分离株基因组核苷酸序列与GenBank已经公布的SFTSV核苷酸序列和白蛉病毒属部分其他病毒进行比对，并构建进化树，进行同源性分析。
结果荧光定量RT-PCR鉴定该疑似病例为阳性，并成功分离获得SFTSV毒株，命名为Zhejiang/01/2011株。对Zhejiang/01/2011株进行RT-PCR扩增并测序拼接得到全基因组cDNA序列，Zhejiang/01/2011株基因组核苷酸序列共有S、M、L 3个片段。其中S片段为1 745个核苷酸，M片段为3 378个核苷酸，L片段为6 368个核苷酸。分子进化分析结果显示，Zhejiang/01/2011株与Japan/SPL004A/2013株相似性最高，其中S片段相似性为98%，M片段为97%，L片段为98%。白蛉病毒属基于3个片段分子系统进化树均显示，Zhejiang/01/2011株与白蛉病毒属部分病毒株中所有的SFTSV病毒株聚集在一起。
结论笔者成功对Zhejiang/01/2011株进行了测序和分子进化分析。Zhejiang/01/2011株是SFTSV，属白蛉病毒属，且其与日本分离株在同一分支，相似性较大，与国内其他地区分离株不在同一分支，差异较大。