,Comparative genomics reveal shared genomic changes in syngnathid fishes and signatures of genetic c

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Syngnathids (seahorses,pipefishes and seadragons) exhibit an array of morphological innovations including loss of pelvic fins,a toothless tubular mouth and male pregnancy.They comprise two subfamilies:Syngnathinae and Nerophinae.Genomes of three Syngnathinae members have been analyzed previously.In this study,we have sequenced the genome ofa Nerophinae member,the Manado pipefish (Microphis manadensis),which has a semi-enclosed brood pouch.Comparative genomic analysis revealed that the molecular evolutionary rate of the four syngnathids is higher than that of other teleosts.The loss of all but one P/Q-rich SCPP gene in the syngnathids suggests a role for the lost genes in dentin and enameloid formation in teleosts.Genome-wide comparison identified a set of 118 genes with parallel identical amino acid substitutions in syngnathids and placental mammals.Association of some of these genes with placental and embryonic development in mammals suggests a role for them in syngnathid pregnancy.
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