胡杨叶片及韧皮部内生细菌多样性及生物学功能分析

来源 :微生物学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:nhk1970
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[目的]通过分析胡杨叶片及树干内生细菌群落多样性、结构特征及生物学功能,探究内生细菌与宿主胡杨的互作机制.[方法]利用Illumina MiSeq高通量测序技术,对采集自新疆喀什地区胡杨林的3组胡杨树叶和3组树干样本的内生细菌进行Alpha、Beta多样性分析、群落组成分析以及通过比对代谢数据库进行群落功能预测,并对样品中内生细菌进行分离纯化鉴定.[结果]胡杨树叶优势菌群依次为变形菌门Proteobacteria(40.71%)、放线菌门Actinobacteria(21.76%)、拟杆菌门Bacteroidetes(14.24%)和厚壁菌门Firmicutes(13.92%);胡杨树干优势菌群为厚壁菌门Firmicutes(56.91%)、放线菌门Actinobacteria(37.01%).PCoA分析结果表明,胡杨树叶与树干的内生细菌群落结构存在明显差异,同类型组织样本群落结构相似.功能预测发现,内生细菌丰度较高的代谢通路及酶大多与细胞壁和细胞膜、外排泵、氧化应激、相容性溶质、能量代谢等相关.并分离到可培养内生细菌44株,分属5个属,其中芽孢杆菌属占比最多.[结论]胡杨叶片中内生细菌的多样性及丰富度均高于树干组织,不同胡杨组织由于生物学功能不同,也影响着内生细菌群落的组成.内生细菌群落的功能与宿主组织有对应关系,胡杨所处生境也影响着其内生细菌群落的功能表达.胡杨可培养内生细菌群落具有耐盐碱等特性,是具有应用潜力的菌种资源.
其他文献
[目的]筛选和鉴定能够降解聚对苯二甲酸乙二醇酯(PET)单体的微生物,并分析代谢途径.[方法]从青岛小涧西固体废弃物综合处置厂采集样品,以PET单体对苯二甲酸为唯一碳源筛选获得能够代谢对苯二甲酸的菌株TPA3;16S rRNA序列分析确定TPA3菌株的分类地位;采用二代和三代高通量测序技术进行基因组de novo测序和分析;通过氨基酸序列比对分析TPA3菌株代谢对苯二甲酸和乙二醇的途径和基因;验证TPA3菌株的可遗传操作性.[结果]TPA3菌株被鉴定为施氏假单胞菌(Pseudomonas stutzeri