【摘 要】
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预测蛋白质的亚细胞定位信息对于了解其功能有重要的意义。选择氨基酸组成、氨基酸对组成、位置特异性打分矩阵三种分类特征以及模糊k近邻、支持向量机两种预测方法,分别进行
【基金项目】
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中国科学技术大学知识创新工程重大项目资助
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预测蛋白质的亚细胞定位信息对于了解其功能有重要的意义。选择氨基酸组成、氨基酸对组成、位置特异性打分矩阵三种分类特征以及模糊k近邻、支持向量机两种预测方法,分别进行了测试。对预测结果的分析显示,位置特异性打分矩阵可以提高对不同亚细胞器的可区分性;而支持向量机可以更好地利用位置特异性打分矩阵特征进行预测。使用氨基酸组成和位置特异性打分矩阵两种特征,并结合支持向量机,是一种有效的亚细胞定位预测方法。
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