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根据已克隆的AVR-Pita及其同源基因序列设计4对引物，对来自菲律宾的74个稻瘟病单孢菌株DNA进行PCR扩增和序列分析，研究了与水稻抗病基因Pi-ta互作的稻瘟病菌无毒基因AVR-Pita及其同源基因序列多态性与进化关系。结果显示，在42个菌株中扩增出AVR-Pita1基因目的条带，31个菌株中扩增出AVR-Pita3基因目的条带，55个菌株中扩增出AVR-Pita4基因目的条带，但所有供试菌株均未扩增出AVR-Pita2基因目的条带。对PCR产物进行测序分析，发现AVR-Pita1基因在菲律宾的生理