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利用ISSR技术对29个金针菇菌株进行了遗传多样性和农艺性状分析，建立了遗传相似性聚类图和农艺性状指标。结果表明，29个金针菇菌株遗传相似性水平在0．67～0．89，在0．67水平上29个菌株被聚为一个类群，在遗传相似性水平为0．70上，将29个金针菇菌株分为4个大类群；在农艺性状上存在较大差异，产量上分为高产类、中产类和低产类，生育期上分为早熟和晚熟两类，子实体形态特征上分为黄色和白色、粗柄和细柄、基部绒毛分为有和无，建立了金针菇主要农艺性状指标。