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无柄目是潮间带生态以及海洋污损生物研究中的模式生物.对无柄目17科77属274种的4种核基因(RP-Ⅱ,EF1,18 S,H3)618条核酸序列分别进行了多序列比对及系统发育分析.基于3种核基因RP-Ⅱ,18 S和H 3的进化树显示,在藤壶亚目Balanomorpha中,古藤壶科Archaeobalanidae、藤壶科Balanidae和塔藤壶科Pyrgomatidae形成单系总科Balanoidea;小藤壶科Chthamalidae与笠藤壶科Tetraclitidae成为单系总科Balanoidea的姊