两种新发现的乙型肝炎病毒/C基因亚型的鉴定

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目的 了解我国西部新发现的两种HBV C/D基因型重组体的基因型特点.方法 采用PCR对来自我国西部地区的17株HBV全基因组序列进行扩增,并利用生物信息学软件对其全基因组结构、遗传距离及重组位点进行分析.结果 两种HBV C/D基因型重组体与HBV基因型A、B、D、E、F的异质性>8%,而与C基因型的异质性为3.8%~8.0%.进化树分析发现,所有C/D重组体与基因型C形成一个大分支,但又独立于C基因型的其他5种哑型而形成明确的另外两个分支,即两个新的HBV/C基因亚型.结论 两种HBVC/D重组体从遗传距离分析属于与C1~C5亚型不同的新的HBV/C基因亚型。

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