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圭山山羊是云南省唯一一个国家级羊类遗传资源保护品种，而红骨圭山山羊是 ２００６年在云南省圭山山羊中发现的特异性个性。本研究选择了分布在全基因组的 ２９个微卫星分子标记分析了红骨圭山山羊和非红骨山羊两个种群的遗传多样性。结果表明，２９个微卫星标记中仅 ７个表现为多态，其中 ＭＡＦ７０，ＳＲＣＲＳＰ２３，ＣＳＲＤ２４７，ＩＬＳＴＳ０８７，ＴＧＬＡ５３，ＤＲＢＰ１共计 ６个微卫星标记表现为 ２个等位基因，Ｐ１９（ＤＹＡ）微卫星座位表现为 ４个等位基因。非红骨和红骨群体微卫星位点平均等位基因数，平均有效等位基因数