基于TCGA数据库构建肝癌预后相关的mRNAs风险评分模型

来源 :标记免疫分析与临床 | 被引量 : 0次 | 上传用户：wl7644719

【摘要】

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目的寻找肝癌(hepatocellular carcinoma)特异性预后相关mRNAs,为肝癌的预后预测及个性化治疗提供策略。方法从癌症和肿瘤基因图谱数据库(The Cancer Genome Atlas,TCGA)下载

【作者】

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向杰陈鹏飞彭湃澜雷蕾

【机构】

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恩施土家族苗族自治州中心医院消化内科

【出处】

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标记免疫分析与临床

【发表日期】

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2021年1期

【关键词】

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肝癌 MRNA 标志物预后 Hepatocellular carcinoma mRNA Biomarker Prognosis

【基金项目】

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湖北省卫生计生科研面上项目(编号:WJ2019M102)

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目的寻找肝癌(hepatocellular carcinoma)特异性预后相关mRNAs,为肝癌的预后预测及个性化治疗提供策略。方法从癌症和肿瘤基因图谱数据库(The Cancer Genome Atlas,TCGA)下载365例肝癌组织样本的Rna-seq数据和临床数据作为训练集,从NCBI(美国国立生物技术信息中心)的GEO数据库下载肝癌相关芯片数据(GSE14520)及临床数据作为测试集;首先,利用LASSO惩罚回归算法在训练集中建立肝癌预后相关的mRNA风险评分(mRNA-risk score,m

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