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基因组上一个基因的所有或大部分外显子位于另一基因内含子和UTR中被称为巢式基因（Nested gene）。巢式基因对（Nested gene pair）是由主基因（Host gene）和巢式基因组成的基因对。文章针对人类基因组上的顺式巢式基因对（简称为巢式基因对）进行全基因组鉴定, 并通过比较巢式基因对在人和小鼠基因组上的保守性分布, 研究巢式基因对的进化方式。保守性分析表明基因转座、序列原位突变和主基因转录起始/终止位点突变是巢式基因对进化的主要原因, 其中主基因转录起始/终止位点突变是巢式基因对独特的