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为分析2009～2011年上海地区手足口病流行病学特征和病原构成，从国家疾病监测信息报告管理系统获取上海市2009～2011年手足口病流行病学资料；采用实时荧光反转录聚合酶链反应（RT-PCR）对来自上海18个区（县）的6676例手足口病病例标本进行肠道病毒核酸检测，对其中257份标本进行病毒分离；对27份人肠道病毒71型（HEV71）毒株进行VPl基因序列全长测定和分析。结果显示，2009～2011年上海市18个区（县）均有手足口病病例报道，地区分布元显著差异；≤5岁的婴幼儿为疾病高发年龄段；4～11月