【摘 要】
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目的:运用网络药理学方法探索中药组方“芩部丹”治疗肺结核的作用机制.方法:运用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索黄芩、百部及丹参的药物活性成分及潜在靶点.结合GeneCards、OMIM、TTD及DrugBank数据库搜索肺结核的相关基因靶点.基于Uniprot数据平台对靶点的基因名称进行整理与规范,在STRING 11.0数据平台上生成“芩部丹”治疗肺结核的靶点蛋白互作网络,利用DAVID 6.8平台对靶点进行功能富集与通路分析,利用Cytoscape 3.7.1软件对“芩部丹”治疗肺结核
【机 构】
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上海中医药大学附属龙华医院呼吸疾病研究所,上海200032;上海中医药大学附属龙华医院肺病科,上海200032
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目的:运用网络药理学方法探索中药组方“芩部丹”治疗肺结核的作用机制.方法:运用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索黄芩、百部及丹参的药物活性成分及潜在靶点.结合GeneCards、OMIM、TTD及DrugBank数据库搜索肺结核的相关基因靶点.基于Uniprot数据平台对靶点的基因名称进行整理与规范,在STRING 11.0数据平台上生成“芩部丹”治疗肺结核的靶点蛋白互作网络,利用DAVID 6.8平台对靶点进行功能富集与通路分析,利用Cytoscape 3.7.1软件对“芩部丹”治疗肺结核的成分、作用靶点、信号通路进行分析与网络构建.结果:最终筛选到的“芩部丹”有效化学成分共计116个,作用靶点含有199个.“芩部丹”治疗肺结核的核心活性成分有木犀草素、汉黄芩素、黄芩素、刺槐素、刺芒柄花素、β-谷甾醇、7-甲氧基-3-甲基-2,5-二羟基-9,10-二氢菲,涉及到潜在靶点82个,关键的作用靶点有TP53、IL6、AKT1、VEGFA、EGFR、PTGS2、JUN、CASP3、STAT3、TNF.GO功能富集分析得到生物学过程373条,分子功能66条,细胞组分39条;KEGG通路富集分析获得108条信号通路,关系最密切的为TNF信号通路和细胞凋亡(P值均＜0.001),其余包括T细胞受体信号通路、PI3K-Akt信号通路及结核病(P值均＜0.001).结论:基于网络药理学解释了中药组方“芩部丹”多成分、多靶点、多通路的肺结核治疗机制,为后期的临床与基础研究提供了一定的理论支持.
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