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中国科学院真菌、地衣系统学重点实验室是1985年成立的中国科学院第一批开放实验室之一，是我国唯一对真菌地衣进行全面的分类学和系统学研究的科研机构。实验室在我国生物多样性研究的基础上，开展真菌地衣重要类群的分类、系统和进化生物学研究，揭示真菌地衣的物种起源与演化的基本规律，真菌与其它生物间的相互作用和协同进化机制；同时开展真菌地衣资源储备和建立资源评价体系，为人口与健康、农业可持续发展和生态环境等国民经济建设作出贡献。