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综述了目前用于赤潮藻的分子生物学检测技术，这些技术总体分为3类，即基于核酸提取的检测技术、全细胞杂交技术和酶联免疫吸附分析技术（ELISA）。分子生物学检测技术能用于自然水样的种群分析、有害赤潮藻种的日常监控、赤潮藻孢囊的鉴别和对压舱水外来生物的检测等。今后研究的重点是如何将各种已建立的检测技术运用干实践，特别是如何提高检测的速度、灵敏度，并发明新的检测设备，实现检测自动化。