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自主创新是一国兴旺发达的不竭动力，是国与国之间科技竞争的焦点。由于技术创新存在市场失灵，所以政府有必要利用政策工具实施干预，以促进本国自主创新事业的发展。从我国实施自主创新政策选择的必要性分析入手，通过对技术创新的理论剖析，得出政府必须运用财税政策实施干预，以及如何进行自主创新导向的财税政策选择。