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利用分布于水稻12条染色体上的190个SNPs位点，对97个水稻品种进行了遗传多样性和遗传结构分析。结果表明，190个SNPs位点中有92个具有多态性，多态性比率为48．42％。品种间的遗传相似系数（GS）变化范围在0．34—1．00之间，平均GS为0．87。贝叶斯聚类和UPGMA法聚类的结果相似，均将供试材料分成籼、粳2个亚种，且品种间的亲缘关系与地理来源关系不大。通过SNPs标记的遗传多样性分析结果表明，供试材料在亚种内的亲缘关系较近、遗传基础狭窄，部分供试品种具有相似的遗传背景。