【摘 要】
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Development of thoracolumbar vertebra (TLV) and rib primordium (RP) is a common evolutionary feature across vertebrates, although whole-organism analysis of the expression dynamics of TLV-and RP-related genes has been lacking. Here, we investigated the si
【机 构】
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State Key Laboratory of Genetic Resources and Evolution,Yunnan Laboratory of Molecular Biology of Do
【出 处】
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基因组蛋白质组与生物信息学报（英文版）
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Development of thoracolumbar vertebra (TLV) and rib primordium (RP) is a common evolutionary feature across vertebrates, although whole-organism analysis of the expression dynamics of TLV-and RP-related genes has been lacking. Here, we investigated the single-cell transcriptome landscape of thoracic vertebra (TV), lumbar vertebra (LV), and RP cells from a pig embryo at 27 days post-fertilization (dpf) and identified six cell types with distinct gene expression signatures. In-depth dissection of the gene expression dynamics and RNA velocity revealed a coupled process of osteo-genesis and angiogenesis during TLV and RP development. Further analysis of cell type-specific and strand-specific expression uncovered the extremely high level of HOXA103′-UTR sequence specific to osteoblasts of LV cells, which may function as anti-HOXA10-antisense by counteracting the HOXA10-antisense effect to determine TLV transition. Thus, this work provides a valuable resource for understanding embryonic osteogenesis and angiogenesis underlying vertebrate TLV and RP development at the cell type-specific resolution, which serves as a comprehensive view on the transcriptional profile of animal embryo development.
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