【摘 要】
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目的:筛选分析多囊卵巢综合征卵丘细胞中与卵母细胞成熟相关的hub基因及其富集通路与注释.方法:下载GEO数据库中的GSE40400数据集,获取多囊卵巢综合征患者中第一次减数分裂期
【机 构】
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广西医科大学 广西 南宁 530021
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目的:筛选分析多囊卵巢综合征卵丘细胞中与卵母细胞成熟相关的hub基因及其富集通路与注释.方法:下载GEO数据库中的GSE40400数据集,获取多囊卵巢综合征患者中第一次减数分裂期或第二次减数分裂期卵母细胞周边分离的各3例卵丘细胞转录组数据;首先使用R筛选差异表达mRNAs;再使用string和cytoscape筛选hub蛋白复合体与hub基因;最后使用kobas数据库对hub基因进行功能富集分析.结果:在多囊卵巢综合征卵丘细胞中共筛选出42种与卵母细胞成熟相关的差异表达mRNAs,进一步从中筛选出1个hub蛋白复合体与11种hub基因(BUB1B、CCNB1、CDC20、CENPE、FAM83D、KIF20A、MND1、PBK、TTK、UBE2C和UHRF1);11种hub基因参与的KEGG通路和GO注释与细胞周期和细胞分裂相关.结论:在多囊卵巢综合征卵丘细胞中筛选出11种异常表达的hub基因,它们参与细胞周期和细胞分裂相关的通路与注释,可能与多囊卵巢综合征中卵母细胞的成熟障碍有关.
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