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利用PCR方法从柱状黄杆菌（Flavobacterium columnare）G4株中克隆了1个胶原蛋白酶基因（GenBank登录号EF501979）。同源性比对发现该基因与柱状黄杆菌的另外1种胶原酶基因（GenBank登录号EAZ95511.1）最为相近,有84%的一致性和93%的相似性。该属的另外2种细菌,约氏黄杆菌（Flavobacterium johnsoniae）和嗜冷黄杆菌（F.psychrophilum）都有与该胶原酶基因相似的基因,其相似性分别为92%和83%。该基因经KpnI和SalI酶