目的：建立人胆汁蛋白质组双向电泳图谱，用于胆汁比较蛋白质组学测定。方法胆汁标本分别取自于1例恶性阻黄（胆管癌）及1例良性阻黄（胆总管结石）的患者，样本经纯化制备后，加载到pH3-10及pH4-7的宽、窄pH范围的IPG胶条上行第一维等电聚焦，后采用12.5％的SDS-PAGE凝胶电泳进行第二维垂直电泳以建立胆汁双向电泳图谱，双向电泳分离的蛋白质点经过银离子染色后采用图像分析软件进行蛋白质组差异分析。结果良恶性胆汁2D图谱中，各分离出250及216个蛋白质点（pH3-10的IPG胶条），182及176个蛋白质点（pH4-7的IPG胶条），在良恶性匹配的蛋白质点中，蛋白表达量存在明显差异的分别有16个（pH3-10的IPG胶条）及23个（pH4-7的IPG胶条）。结论此研究建立了一套适用于胆汁双向电泳的稳定的胆汁样本纯化制备方法，在这个基础上得到了高分辨率和高重复性的人胆汁蛋白质组双向电泳图谱，通过良恶性的双向电泳图谱的差异分析，发现了差异表达的蛋白质点，为经胆汁筛选胆道疾病以及胆道肿瘤诊断奠定了研究基础。