【摘 要】
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依据草菇(Volvariella volvacea)基因组和转录组数据,采用ZOOM软件将转录组Reads定位到基因组的分析方法,从草菇中鉴定了一个多糖单加氧酶基因Vv-lpmo1,对其进行生物信息学分析
【机 构】
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福建农林大学园艺学院,福建农林大学生命科学学院菌物研究中心,福建农林大学食品科学学院
【基金项目】
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国家“973项目”(2014CB138302), 国家现代农业产业技术体系建设专项资金(CARS24), 福建农林大学优秀博士学位论文资助基金(YB2013007)的部分研究内容
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依据草菇(Volvariella volvacea)基因组和转录组数据,采用ZOOM软件将转录组Reads定位到基因组的分析方法,从草菇中鉴定了一个多糖单加氧酶基因Vv-lpmo1,对其进行生物信息学分析,并对其高效诱导物进行筛选,采用定量PCR方法研究其在降解稻草时表达量的变化规律。结果表明:草菇Vv-lpmo1基因DNA序列长1432bp,有9个内含子,预测编码305个氨基酸的蛋白质;生物信息学分析表明该蛋白质有分泌信号肽,且含有两个完整的保守结构域:N端的glycoside hydrolase fa
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