【目的】研究新疆树上干杏种内形态学性状的多样性,为其相关特性和优良种质资源的筛选提供基础资料。【方法】以新疆伊犁地区的6个树上干杏株系为材料,在2008年前期调查的基础上,于2009和2010年连续2年系统观测6个株系的1年生枝、皮孔、叶片、花及果实的19项形态学指标,用单因素方差分析法评价各指标的变异程度,并对各指标的相关性进行分析。【结果】树上干杏6个株系的花冠直径、叶长、叶宽、节间长、果实和果核大小等形态学性状均存在差异;各形态指标在种内存在一定的变异,变异系数最大的为单果质量(26.22%),其次为核鲜质量(20.49%),与花、叶相关性状的变异系数相对较低;19项形态学指标间存在一定的相关性,多个性状间的相关性达显著或极显著水平。【结论】树上干杏的种内变异丰富,可以通过对一些形态学性状的早期选择,获得果实综合性状优良的品种。