目的分析2016—2018年松江区传染病早期预警信号和传染病类苗子事件的特征和关系,为优化区域传染病早期预警提供依据。方法通过"传染病自动预警信息系统"下载预警信号,通过"松江区传染病类苗子事件报告登记表"整理苗子事件,应用SPSS 16.0软件按年份、病种等因素分析。结果 2016—2018年松江区共预警传染病15类1 081次,年平均预警360次。主要预警病种为水痘、手足口病、其他感染性腹泻、流行性感冒、猩红热和麻疹等,以时间预警信号为主。2016—2018年时间预警信号分别占85.50%、 90.83%和58.41%,不同年份间的差异有统计学意义(x~2=128.96, P<0.05)。同时期共报告传染病类苗子事件19类478起,年平均159起,其中区级事件475起(99.37%),主要苗子事件为手足口病、水痘、麻疹和感染性腹泻。2016—2018年松江区水痘、手足口病、其他感染性腹泻、麻疹、流行性感冒、猩红热和疟疾的早期预警信号全部探测到其对应病种的苗子事件,符合率中位数48.52%;同时苗子事件报告还预警了百日咳、狂犬病和伤寒等疫情76起。结论松江区国家传染病自动预警系统整体运行良好,而苗子事件报告体系的预警效率更高,可作为国家传染病自动预警信息系统的有效补充。